NCI公開全球最大的腫瘤基因數(shù)據(jù)庫Amresco官網(wǎng)
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NCI公開全球最大的腫瘤基因數(shù)據(jù)庫2015-5-2 作者：MedSci 來源：MedSci 我要評(píng)論9Tags: 腫瘤 基因 數(shù)據(jù)庫分享到：在個(gè)體化治療的廣闊前景下，美國、英國和臺(tái)灣都大力建設(shè)自己的腫瘤基因組數(shù)據(jù)庫，希望通過腫瘤數(shù)據(jù)庫的建設(shè)實(shí)現(xiàn)腫瘤患者個(gè)體化治療，其中的變異基因分型后將成為腫瘤藥物的攻擊靶點(diǎn)，從而實(shí)現(xiàn)在基因組水平上對(duì)腫瘤進(jìn)行靶向性治療。
美國國家腫瘤研究所（NCI）已公開迄今為止規(guī)模最大的腫瘤相關(guān)的變異基因數(shù)據(jù)庫，這些遺傳信息可對(duì)腫瘤進(jìn)行基因分型，其致癌基因的分子機(jī)制為靶向治療提供依據(jù)。具有應(yīng)用價(jià)值的是，研究人員利用腫瘤患者的基因組信息可設(shè)計(jì)出個(gè)體化的、基于基因分型的治療方案。美國國家腫瘤研究所在周一聲明稱：“這一基于基因組研究的新數(shù)據(jù)庫向全球開放，希望幫助科學(xué)家加快新藥研發(fā)以及為病人提供適合的療法。”該機(jī)構(gòu)的分子藥理研究室主任Yves Pommier博士稱：“目前大多數(shù)抗癌藥的使用都是按照醫(yī)療經(jīng)驗(yàn)，對(duì)于多數(shù)人而言，能理解的是藥物作用靶點(diǎn)，卻不知道其與基因組學(xué)上的任何關(guān)聯(lián)。”多數(shù)腫瘤的治療無法回避猜測性治療，這是因?yàn)獒t(yī)生不能確定病人對(duì)常用藥物和化療的反應(yīng)，或者是腫瘤已形成抗藥性。為了實(shí)現(xiàn)個(gè)體化醫(yī)療以擺脫猜測性治療，美國國家腫瘤研究所推動(dòng)基因組學(xué)在腫瘤治療的應(yīng)用，其測序了60種人類腫瘤細(xì)胞系并創(chuàng)建了腫瘤細(xì)胞數(shù)據(jù)庫，從而生成了人體不同部位的腫瘤相關(guān)的變異基因詳細(xì)目錄，該研究成果發(fā)表在美國腫瘤協(xié)會(huì)期刊《腫瘤研究》(Cancer Research)上。Pommier博士稱：“研究人員可挖掘腫瘤遺傳數(shù)據(jù)以確定化療藥物Cisplatin是否能治療特定的基因突變，具有說服力的是，僅有一半的子宮癌患者對(duì)Cisplatin藥物有反應(yīng)，而醫(yī)藥公司不愿證實(shí)現(xiàn)有的腫瘤藥物僅能適用于一種類型的腫瘤患者。”最近審批的多數(shù)腫瘤藥物都是靶向性治療，以阻止腫瘤細(xì)胞在生長和擴(kuò)增過程中需要的特定途徑，因此，在接受腫瘤藥物治療之前，應(yīng)該確認(rèn)患者具有特定的遺傳突變，從而讓藥物更有利于治療其疾病。羅氏旗下的AG公司研制的黑色素瘤藥Zelboraf，能有效地作用于約一半的黑色素瘤患者出現(xiàn)的特定突變基因；輝瑞公司研制的腫瘤藥物Xalkori，能靶向治療約4%肺癌患者出現(xiàn)的ALK基因突變。腫瘤基因組數(shù)據(jù)庫的建設(shè)2007年1月，臺(tái)灣建成全球首個(gè)單一癌癥的基因變異數(shù)據(jù)庫，該變異數(shù)據(jù)庫有利于研發(fā)檢測腫瘤基因的芯片以促進(jìn)臨床診斷和藥物發(fā)展。臺(tái)灣中央研究院生物醫(yī)學(xué)研究所研究員周玉山稱，該研究挖掘出614個(gè)肝癌易感基因的組合，結(jié)合肝癌患者變異基因后找到38個(gè)候選的肝癌致病基因，并在患有肝癌的人類和老鼠體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了候選基因的遺傳證據(jù)。該數(shù)據(jù)庫已于2006年2月對(duì)外開發(fā)，吸引了美國、歐盟和大陸等國家地區(qū)的研究人員進(jìn)入其中搜集研究數(shù)據(jù)。2013年1月，加州大學(xué)開放了腫瘤基因組數(shù)據(jù)庫，其數(shù)據(jù)來自于美國國家癌癥研究院的基因組項(xiàng)目，為那些分析腫瘤測序數(shù)據(jù)的科學(xué)家?guī)砹朔奖恪＿@一被稱為“癌癥基因組學(xué)中心”的數(shù)據(jù)庫由加州大學(xué)圣塔克魯斯分校的一個(gè)團(tuán)隊(duì)建立的，收集了1萬位腫瘤患者（20種腫瘤類型）的正常細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞樣本信息。該數(shù)據(jù)庫將收錄NCI兒童和艾滋病相關(guān)腫瘤基因組項(xiàng)目的數(shù)據(jù)，還將從接管的NIH國家生物技術(shù)信息中心獲得腫瘤測序數(shù)據(jù)。2013年6月，英國廣播公司報(bào)道，英國將建立世界最大的腫瘤患者數(shù)據(jù)庫，收集英國每年35萬新確診的腫瘤病例的遺傳數(shù)據(jù)以實(shí)現(xiàn)針對(duì)癌癥類型的個(gè)體化醫(yī)療。新建的英國腫瘤數(shù)據(jù)庫的遺傳數(shù)據(jù)來自各地醫(yī)療機(jī)構(gòu)的病例和1100萬份歷史檔案記錄，還與威爾士和蘇格蘭等醫(yī)療保健數(shù)據(jù)庫實(shí)現(xiàn)信息共享，并在數(shù)據(jù)的整理、分析和更新中揭示各種腫瘤對(duì)治療方法的反應(yīng)。英格蘭公共健康主管拉什巴斯介紹說，這個(gè)數(shù)據(jù)庫將從根本上改變癌癥的診斷和治療。
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