主要功能用途
Applied Biosystems QuantStudio 5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀擁有OptiFlex光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)和Veriflex溫控?zé)嵫h(huán)模塊,可通過(guò)實(shí)時(shí)采集PCR反應(yīng)體系中的熒光信號(hào),分析樣品中靶序列的有無(wú)和初始濃度高低,實(shí)現(xiàn)快速、準(zhǔn)確、可靠地定性(陰性/陽(yáng)性)、相對(duì)定量和絕對(duì)定量(檢測(cè)起始模板數(shù)的精確拷貝數(shù))檢測(cè)。主要應(yīng)用包括:1、基因表達(dá)分析動(dòng)植物和微生物在生理病理、環(huán)境及外來(lái)脅迫下相關(guān)基因表達(dá)的變化分析以及SiRNA誘導(dǎo)基因沉默和基因敲除后特定基因表達(dá)水平的檢測(cè)。2、miRNA表達(dá)水平的檢測(cè)基于miRNA與特定靶基因mRNA表達(dá)水平變化間的關(guān)聯(lián),研究miRNA 調(diào)控基因表達(dá)機(jī)制。3、基因分型(SNP genotyping,Genotyping)利用TaqMan探針、飽和DNA染料HRM曲線分析進(jìn)行基因分型,得出等位基因頻率、基因型占總基因型比率等。可應(yīng)用于如遺傳病診斷,SNP基因分型,藥物代謝酶DME基因分型,法醫(yī)遺傳學(xué)鑒定等。4、拷貝數(shù)變異(CNV)拷貝數(shù)變異(Copy number variation, CNV)是指因基因組發(fā)生重排而導(dǎo)致長(zhǎng)度1KB以上的基因片段的缺失(減少)、插入、重復(fù)(增加)、重排、倒 位、DNA 拷貝數(shù)目變化,也稱為拷貝數(shù)多態(tài)性(copy number polymorphisms, CNPs)。是造成物種個(gè)體差異和人類許多疾病(如癌癥、遺傳性疾病、心血管疾病)的一種重要遺傳基礎(chǔ)。熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)初始樣品的某個(gè)DNA 片段的拷貝數(shù)進(jìn)行定量,用已知拷貝數(shù)為2的DNA內(nèi)參校正而實(shí)現(xiàn)對(duì)目DNA 片段拷貝數(shù)的確認(rèn)。5、高分辨率溶解曲線分析(High resolution melt, HRM)DNA序列長(zhǎng)度、GC 含量及堿基互補(bǔ)性差異影響DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的熱穩(wěn)定性。高分辨熔解曲線(high-resolution melt,HRM) 分析是通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)升溫過(guò)程中與雙鏈DNA特異性結(jié)合的熒光染料釋放的綠色熒光強(qiáng)度的變化,了解PCR 產(chǎn)物中DNA分子的解鏈溫度情況,分析樣品特定基因片段DNA組成變化。實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)運(yùn)行程序中引入溶解曲線分析環(huán)節(jié)后,可借助于專用HRM分析模塊完成HRM分析。HRM用于突變掃描和基因分型,不受突變堿基位點(diǎn)和種類限制,既可對(duì)未知突變進(jìn)行篩查、掃描,又能對(duì)已知突變進(jìn)行分析,還可用于STR分析。6、病原體檢測(cè)(Pathogen detection)實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀能可靠用于臨床醫(yī)學(xué)人體上呼吸道的感染、肺炎、消化道感染、中樞神經(jīng)系統(tǒng)等疾病,以及畜牧業(yè)、農(nóng)作物病蟲(chóng)害的病原體的檢測(cè)確認(rèn)、感染嚴(yán)重程度的量化評(píng)估。7、蛋白熱穩(wěn)定性分析(Protein thermal shift)利用實(shí)時(shí)定量PCR儀來(lái)分析熱穩(wěn)定性,進(jìn)行配體-蛋白結(jié)合的高通量篩選,突變或修飾對(duì)蛋白熱穩(wěn)定性的影響使用蛋白結(jié)合染料(如Protein Thermal Shift 染料),實(shí)時(shí)定量PCR系統(tǒng)上運(yùn)行實(shí)時(shí)熔解實(shí)驗(yàn),根據(jù)因蛋白熔解導(dǎo)致熒光圖像差異,分析配體與蛋白的結(jié)合穩(wěn)定性。可用于以高通量篩選配體與蛋白的結(jié)合, 篩選能與蛋白靶點(diǎn)結(jié)合的小分子和片段文庫(kù)候選藥物、抗體,鑒定最佳緩沖液條件以改善蛋白的純化和分離等。8、食品安全和GMO(genetically modified organism)檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)用于食品的微生物污染監(jiān)測(cè)、肉食類食品食材來(lái)源和組成的檢驗(yàn)、如轉(zhuǎn)基因動(dòng)植物基因的檢測(cè)等。9、耐藥基因檢測(cè)等
性能特點(diǎn)
QuantStudio 5實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀體型小巧,既能通過(guò)簡(jiǎn)單直觀的大尺寸彩色觸摸屏交互式操作,也可以進(jìn)行常規(guī)PC聯(lián)機(jī)操作和數(shù)據(jù)處理。1、多種樣品通量可選同時(shí)支持標(biāo)準(zhǔn)和快速反應(yīng)模式:標(biāo)準(zhǔn)模式運(yùn)行時(shí)間不到2小時(shí),快速模式可在30分鐘內(nèi)獲得結(jié)果;QuantStudio 5支持96×0.2mL或 96×0.1mL Fast或384孔模塊三種反應(yīng)模塊;
2、VeriFlex 梯度控溫技術(shù)Applied Biosystems 96孔模塊采用了Veriflex梯度溫控技術(shù),具有六個(gè)獨(dú)立的溫度區(qū),可實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的溫度控制和優(yōu)化。3、先進(jìn)的OptiFlex光學(xué)系統(tǒng)OptiFlex技術(shù)具有高亮度白光半導(dǎo)體光源和檢測(cè)系統(tǒng),確保孔與孔間測(cè)試數(shù)據(jù)精確;具有更靈敏數(shù)據(jù)采集性能,可檢測(cè)單重分析反應(yīng)中1.5倍的拷貝數(shù)差異,獲得10log線性動(dòng)態(tài)范圍;具有多重實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)功能,最多可支持靶標(biāo)數(shù)可達(dá)6個(gè)。
4、qPCR 數(shù)據(jù)分析軟件分析軟件具有桌面版和基于Web瀏覽器版,能夠支持云端服務(wù)器平臺(tái),能實(shí)時(shí)在線通過(guò)云平臺(tái)進(jìn)行遠(yuǎn)程控制實(shí)驗(yàn);可選 Applied Biosystems 云端qPCR 數(shù)據(jù)分析軟件模塊,實(shí)現(xiàn)強(qiáng)大的分析功能;將實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)實(shí)現(xiàn)云端安全存儲(chǔ),便于在線分享測(cè)試結(jié)果。
5、21 CFR Part 11合規(guī)管理功能21 CFR Part 11合規(guī)管理軟件,內(nèi)含安全、審計(jì)、電子簽名套件,實(shí)現(xiàn)運(yùn)行和數(shù)據(jù)的合規(guī),適用于需要合規(guī)認(rèn)證要求的實(shí)驗(yàn)室使用。
6、新型技術(shù)服務(wù)支持由經(jīng)過(guò)專業(yè)培訓(xùn)的現(xiàn)場(chǎng)服務(wù)工程師現(xiàn)場(chǎng)安裝SmartStart Orientation 實(shí)踐培訓(xùn)套餐使用智能遠(yuǎn)程支持工具更快地排除故障和解決問(wèn)題。
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