Bio-Rad微滴式數字PCR技術（ddPCR）是第三代PCR技術，無需標準參照物質即可給出樣本的拷貝數濃度而非Ct值，其檢測結果為判讀提供量化的依據。根據LOB(limit of blank)和未知樣本的定量結果作出判讀，可避免人為錯誤，縮小灰區，提高檢出率。
ddPCR獨有的微滴處理技術，使其對PCR擴增效率的變化不再敏感，不懼含有PCR抑制物樣本的挑戰。隨著疫情的變化以及流行病學調研的推進，更多類型的檢測乃至環境監測也可能需要進行，ddPCR的這一優勢會發揮作用。此外，如果新型冠狀病毒發生變異，病毒基因序列上引物、探針靶向位置出現SNV，ddPCR亦能克服引物、探針結合能力下降帶來的擴增效率變化，確保穩定檢出。不僅如此，還能根據樣本微滴熒光信號的變化，發現引物探針靶標區域可能出現變異的病例，為NGS測序分析病毒變異提供樣本，助力流行病學研究。
應用如下
2019- nCoV病毒檢測方法
疑似病人的快速取樣和檢測是防止疫情擴散的當務之急。目前新型冠狀病毒的診斷，是在符合疑似病例標準的基礎上，對痰液、咽拭子、下呼吸道分泌物等樣本進行熒光定量PCR（RT-qPCR）檢測。中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所推薦選用針對新型冠狀病毒的開放讀碼框1ab（open reading frame, ORF1ab）、核殼蛋白（nucleoprotein，N）基因區域的引物和探針序列：
Target 1（ORF1ab）:
正向引物（F）：CCCTGTGGGTTTTACACTTAA
反向引物（R）：ACGATTGTGCATCAGCTGA
熒光探針（P）：5'-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3'
Target 2（N）:
正向引物（F）：GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT
反向引物（R）：CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG
熒光探針（P）：5'-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-BHQ1-3'
在熒光定量PCR上的結果判斷：
陰性:無Ct值或Ct為40；
陽性：Ct值<37，可報告為陽性；
可疑：Ct值在37-40之間，建議重復實驗，若重做結果Ct值<40，擴增曲線有明顯起峰，該樣本判斷為陽性,否則為陰性。
數字PCR實驗，建議采用官方機構推薦的引物、探針序列，結合Bio-Rad ddPCR RNA一步法預混液，經優化反應條件后使用。實驗步驟如下圖：
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