TOYOBO東洋紡KOD -Plus- Neo高速PCR酶
KOD DNA polymerase具有強力的3’→5’核酸外切酶活性(校正活性),可準(zhǔn)確地對目的片段進(jìn)行擴增,作為克隆用PCR酶獲得了廣泛的好評。然而,高保真性PCR酶在20?30循環(huán)以后,容易出現(xiàn)擴增無法持續(xù)的<停滯現(xiàn)象>。KOD -Plus- Neo在高保真性PCR酶:KOD -Plus-系列技術(shù)的基礎(chǔ)上,應(yīng)用了本公司新開發(fā)的「延伸增強劑」,保持了KOD -Plus-系列高保真性(約為Taq的80倍)的同時,通過抑制<停滯現(xiàn)象>,明顯提高了對微量模板DNA、長目的片段的擴增效率。
TOYOBO東洋紡KOD -Plus- Neo高速PCR酶
特征:
特征1. 可對微量模板DNA進(jìn)行高保真?高效率的擴增通過應(yīng)用延伸增強劑技術(shù),即便是微量模板DNA也可對目的基因進(jìn)行高保真?高效率的擴增。同時本酶具備高保真性(約為Taq的80倍),可準(zhǔn)確地對低拷貝數(shù)模板的目的基因進(jìn)行擴增。此外,由于使用抗體的熱啟動法,因此可進(jìn)行特異性良好的擴增。
特征2. 縮短了延伸時間<30sec./kb>?。ㄩL目的片段更方便)延伸時間從原產(chǎn)品的60sec./kb縮短到30sec./1kb。對長目的片段的擴增更加方便。
特征3. 實現(xiàn)了各種引物同一循環(huán)條件通過對反應(yīng)Buffer組成的zui適化,與原來的KOD DNA polymerase相比,延伸性?擴增效率有了大幅的提升。實現(xiàn)了無需探討循環(huán)條件。20mer以上的引物(Tm值>63℃)可先嘗試2步法。無需探討非常簡便。*Tm值采用zui鄰近法(Nearest Neighbor method)計算得到的值。
特征4. 長目的片段的擴增提高了延伸性,可對各種長度的目的片段進(jìn)行擴增。已通過實驗確認(rèn)可對24kb的基因組DNA 進(jìn)行擴增。
實驗例1. 對來自Total RNA的各種基因全長ORF的擴增實驗例2. 微量Template的擴增實驗例3. 各種長度目的片段的擴增效率?延伸性的比較
<幾點建議>●PCR產(chǎn)物的克隆由于本酶的PCR產(chǎn)物已被平滑化,可用平滑末端克隆法進(jìn)行克隆。此時,如已對載體進(jìn)行了脫磷酸化處理,就需要對PCR產(chǎn)物進(jìn)行磷酸化,或使用帶5'磷酸基的引物?!×硗猓捎诒久傅腜CR產(chǎn)物已被平滑化,不能直接進(jìn)行TA克隆??墒褂冒匆韵路椒ㄩ_發(fā)的TA克隆試劑盒「TArget Clone -Plus-」。*包含于TArget Clone -Plus-(Code No. TAK-201)中。**推薦使用Ligation high Ver.2 (Code No. LGK-201)。
<注意>●引物的設(shè)計3'端有錯配的引物,可能會受本酶校正。
簡要備注① 關(guān)于Polymerase應(yīng)用于PCR的DNA polymerase大致可分為2大類。一類是從嗜熱菌中分離出來的被稱為polⅠ型的聚合酶,以Taq、Tth DNA polymerase為代表。另一類是從超嗜熱Archaea中分離出來的被稱為α型的聚合酶,KOD、Pfu DNA polymerase屬于該類。α型酶具有polⅠ型酶所沒有的3'→5核酸外切酶活性。該活性被稱為Proof-reading(校正)活性,與PCR的保真性有著非常深厚的淵源。KOD DNA polymerase利用該Proof-reading活性,表現(xiàn)出很高的保真性。但具備該活性的酶一般被認(rèn)為對PCR反應(yīng)效率有不好的影響。KOD -Plus- Neo通過應(yīng)用新的延伸增強劑、熱啟動法、以及Buffer組分的改良,大大提高了PCR效率。
Memo② 什么是熱啟動?在室溫條件下配制PCR反應(yīng)溶液時,配制過程中聚合酶會開始反應(yīng)。在室溫下由于引物的特異性降低,很容易產(chǎn)生非特異性反應(yīng)等副反應(yīng)。另外,KOD DNA polymerase具有很強的3'→5'核酸外切酶活性(Proof reading活性),這也是產(chǎn)生副反應(yīng)的原因之一。熱啟動法是指在高溫階段,激活聚合酶活性的方法,迄今為止已有好多種方法。其中zui嚴(yán)格的是使用中和抗體的方法。KOD -Plus- Neo中由于混合了兩種抗Taq DNA polymerase抗體,在常溫狀態(tài)下可*抑制聚合酶的活性及校正活性。而該抑制作用在PCR的預(yù)變性階段*失活,對PCR沒有任何影響。
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