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Profinia 蛋白純化系統設計緊湊，方便使用。每一個組件都標注清晰以便快速安裝。緩沖液部分便于用戶放置溶液 — 儀器上的位置編號與運行圖和預包裝試劑上的標簽相匹配。樣品部分可以依次進行兩種樣品的純化。這兩部分都含有吸管用于樣品和緩沖液的吸取。預裝柱部分提供了兩步純化的能力，而且使用Luar的接頭方便預裝柱的連接。廢液收集瓶和稀釋液瓶分別位于儀器的兩側。組分收集和樣品部分的獨特設計使標準收集管的安裝快速而簡便。儀器的中央部分能夠提供方便的存儲，USB 接口可輕松地將數據導出。

該儀器有一個很大的觸摸屏式的用戶界面，用戶可以選擇指尖或手寫筆進行界面的切換。直觀友好的幫助功能可以引導用戶使用預設的純化方法進行啟動和運行后操作。操作方法和緩沖液設置還包括了清洗步驟，能自動維護系統并準備下一次純化的預裝柱，以確保 Profinia 蛋白純化系統能維持最佳的運行狀態。這些功能的組合，使用戶能快速啟動，然后即可離開，直到 30 分鐘再返回直接獲取結果。