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品牌: biomedworld 公司: 沃登醫(yī)學(xué)

提供商： 沃登醫(yī)學(xué) 服務(wù)名稱： 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序一、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)簡(jiǎn)介轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究對(duì)象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有mRNA的總和。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究是基因功能及基因結(jié)構(gòu)等研究的基礎(chǔ)，通過新一代高通量測(cè)序，能夠全面快速的獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄組序列信息，已廣泛應(yīng)用于臨床診斷、基礎(chǔ)研究和藥物研發(fā)等領(lǐng)域。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序針對(duì)的是有參考基因組的物種。用新一代高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)某物種的特定組織或細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，與參考基因組比較，可以得到基因表達(dá)差異、可變剪接、融合基因等遺傳調(diào)控信息。本公司擁有最熟練的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，我們的技術(shù)具備以下特點(diǎn)：1. 通量高：每個(gè)樣品4G以上的數(shù)據(jù)產(chǎn)出量，海量數(shù)據(jù)用于分析；2.覆蓋度高：能覆蓋到幾乎所有轉(zhuǎn)錄本片段的序列；3.分辨率高：?jiǎn)螇A基分辨率；4.檢測(cè)閾值廣：從幾個(gè)到數(shù)十萬個(gè)拷貝精確計(jì)數(shù)，可同時(shí)鑒定及定量正常和稀有轉(zhuǎn)錄本；5.分析有深度：可鑒定RNA編輯、可變剪接、基因融合等轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控現(xiàn)象；6.數(shù)字化信號(hào)：?jiǎn)魏塑账岱直媛实木_度，不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的模擬信號(hào)帶來的交叉反應(yīng)和背景噪音。二、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)內(nèi)容1.服務(wù)流程：2.轉(zhuǎn)錄組信息分析：1） 對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行去除接頭污染序列及低質(zhì)量 reads 的處理；2） 測(cè)序評(píng)估（比對(duì)統(tǒng)計(jì)、測(cè)序隨機(jī)性評(píng)估、Reads在基因組上的分布）；3） 基因表達(dá)注釋（基因覆蓋度、覆蓋深度分布等）；4） 基因差異表達(dá)分析（兩個(gè)或兩個(gè)以上樣品）；5） 差異基因的表達(dá)模式聚類分析（需要確定對(duì)符合哪些條件的差異表達(dá)基因做聚類分析）；6） 差異表達(dá)基因GO功能富集分析；7） 差異表達(dá)基因Pathway顯著性富集分析；8） 對(duì)基因結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化；9） 鑒定基因的可變剪接；10） 新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)及注釋；11） SNP分析。3. 個(gè)性化信息分析：（≥5個(gè)樣本）1） 融合基因分析；2） 基因共表達(dá)分析。三、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)說明1. 樣品類型：細(xì)胞、新鮮組織或RNA樣品；2. 樣品需求量：細(xì)胞樣品≥1×107個(gè)，動(dòng)物組織≥1g，植物組織≥2g，RNA≥10 μg；3. 樣品濃度：RNA樣品≥100 ng/μl；4. 樣品純度：OD260/OD280在1.8-2.2之間，OD260/OD230≥2，28S/18S≥1，動(dòng)物樣品RIN≥ 7.0，植物樣品RIN≥6.5，RNA無明顯降解；5. 數(shù)據(jù)量：6G clean data/樣本；6. 項(xiàng)目運(yùn)轉(zhuǎn)周期：標(biāo)準(zhǔn)流程的運(yùn)轉(zhuǎn)周期為約40個(gè)工作日；7. 若另有疑問歡迎向本公司咨詢，我們將竭誠為您服務(wù)。四、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)質(zhì)量承諾1. 準(zhǔn)確可靠的轉(zhuǎn)錄組重測(cè)序結(jié)果；2. 專業(yè)權(quán)威的轉(zhuǎn)錄組重測(cè)序分析報(bào)告；3. 真實(shí)的原始實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)；4. 詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)步驟。