品牌: biomics
公司: 百奧邁科生物技術(shù)有限公司
提供商: Biomics Biotech 服務(wù)名稱: sgRNA活性檢測
產(chǎn)品詳情請聯(lián)系金山科研平臺(tái)微信:jinshanbio Biomics提供多種sgRNA活性檢測方法,包括SSA luciferase報(bào)告系統(tǒng)、Surveyor法、Q-PCR、突變點(diǎn)基因測序等SSA檢測:根據(jù)客戶要求檢測sgRNA的活性及敲除效率,客戶也可以選購我公司Precut pSG-target Cloning kit自行構(gòu)建報(bào)告載體用于檢測,我公司提供陽性及陰性sgRNA及其SSA report target質(zhì)粒。檢測原理:SSA報(bào)告質(zhì)粒(pSG-target)中l(wèi)uciferase基因被終止密碼子提前終止,這種截短的luciferase沒有活性。為檢測sgRNA的剪切活性,將Cas9/sgRNA的靶點(diǎn)序列插入到終止密碼子之后。在Cas9和sgRNA的作用下,靶點(diǎn)位置的序列被有效剪切形成DSB,細(xì)胞通過同源重組重新形成有活性的luciferase(Figure 1),通過檢測luciferase的活性升高就可以反應(yīng)Cas9/sgRNA的剪切活性(Figure 2)
Figure 2. Restore disrupted luciferase function via sgRNA-mediated homologous recombinationFigure 3.Increased FL/RL ratio in Cas9/sgRNA transfection cells.
Surveyor法及測序驗(yàn)證:
CRISPR/Cas9打靶基因后引入的突變的方式與ZFN、TALEN基本一致,都是NHEJ或是HR。因此在CRISPR/Cas9的應(yīng)用中,活性檢測或是突變效率的檢測可以參照ZFN和TALEN方法.主要包括有:靶位點(diǎn)直接PCR后TA克隆測序和基于可以識(shí)別錯(cuò)配雙鏈的錯(cuò)配內(nèi)切酶檢測法(Surveyor法)。 Surveyor法即錯(cuò)配酶法:靶序列經(jīng)CAS/sgRNA切割后由于缺乏修復(fù)模板,將主要以非同源重組的方式進(jìn)行修復(fù),或多或少會(huì)插入或刪除一些堿基。因此將靶序列PCR擴(kuò)增后經(jīng)變性、退火,將形成錯(cuò)配。錯(cuò)配酶(主要是CEL1或T7E1酶)將識(shí)別錯(cuò)配的雜合雙鏈并剪切。產(chǎn)物跑電泳,比較切割條帶與未切割條帶的比例,即可反映出Cas/sgRNA的活性。
BiomicsCRISPR/Cas9相關(guān)產(chǎn)品:Precut pSG-target Cloning kit & SSA assayDifferent type cas9 expression plasmidCRISPR /Cas9載體T7 sgRNA MICscriptTM KIT/sgRNA synthesis productPrecut SgRNA Cloning kit & pSD-gRNA PlasmidEzOmicsTM RNA QUICK clear KIT-------一步純化RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物Biomics CRISPR相關(guān)服務(wù):sgRNA序列設(shè)計(jì)sgRNA表達(dá)載體構(gòu)建sgRNA體外合成全基因組sgRNA文庫的構(gòu)建sgRNA活性檢測Surveyor法及測序驗(yàn)證穩(wěn)定表達(dá)Cas9蛋白細(xì)胞株篩選利用CRISPR系統(tǒng)進(jìn)行基因重組donor質(zhì)粒構(gòu)建植物CRISPRCRISPR/Cas9技術(shù)討論群:342716231微信號(hào):Biomics-RNAi
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