主要功能用途
Applied Biosystems QuantStudio 3實時熒光定量PCR儀擁有OptiFlex光學檢測系統和Veriflex溫控熱循環模塊,可通過實時采集PCR反應體系中的熒光信號,分析樣品中靶序列的有無和初始濃度高低,實現快速、準確、可靠地定性(陰性/陽性)、相對定量和絕對定量(檢測起始模板數的精確拷貝數)檢測。主要應用包括:1、基因表達分析動植物和微生物在生理病理、環境及外來脅迫下相關基因表達的變化分析以及SiRNA誘導基因沉默和基因敲除后特定基因表達水平的檢測。2、miRNA表達水平的檢測基于miRNA與特定靶基因mRNA表達水平變化間的關聯,研究miRNA 調控基因表達機制。3、基因分型(SNP genotyping,Genotyping)利用TaqMan探針、飽和DNA染料HRM曲線分析進行基因分型,得出等位基因頻率、基因型占總基因型比率等。可應用于如遺傳病診斷,SNP基因分型,藥物代謝酶DME基因分型,法醫遺傳學鑒定等。4、拷貝數變異(CNV)拷貝數變異(Copy number variation, CNV)是指因基因組發生重排而導致長度1KB以上的基因片段的缺失(減少)、插入、重復(增加)、重排、倒 位、DNA 拷貝數目變化,也稱為拷貝數多態性(copy number polymorphisms, CNPs)。是造成物種個體差異和人類許多疾病(如癌癥、遺傳性疾病、心血管疾病)的一種重要遺傳基礎。熒光實時定量PCR檢測初始樣品的某個DNA 片段的拷貝數進行定量,用已知拷貝數為2的DNA內參校正而實現對目標DNA 片段拷貝數的確認。5、高分辨率溶解曲線分析(High resolution melt, HRM)DNA序列長度、GC 含量及堿基互補性差異影響DNA雙鏈結構的熱穩定性。高分辨熔解曲線(high-resolution melt,HRM) 分析是通過實時監測升溫過程中與雙鏈DNA特異性結合的熒光染料釋放的綠色熒光強度的變化,了解PCR 產物中DNA分子的解鏈溫度情況,分析樣品特定基因片段DNA組成變化。實時熒光定量PCR實驗運行程序中引入溶解曲線分析環節后,可借助于專用HRM分析模塊完成HRM分析。HRM用于突變掃描和基因分型,不受突變堿基位點和種類限制,既可對未知突變進行篩查、掃描,又能對已知突變進行分析,還可用于STR分析。6、病原體檢測(Pathogen detection)實時熒光定量PCR儀能可靠用于臨床醫學人體上呼吸道的感染、肺炎、消化道感染、中樞神經系統等疾病,以及畜牧業、農作物病蟲害的病原體的檢測確認、感染嚴重程度的量化評估。7、蛋白熱穩定性分析(Protein thermal shift)利用實時定量PCR儀來分析熱穩定性,進行配體-蛋白結合的高通量篩選,突變或修飾對蛋白熱穩定性的影響使用蛋白結合染料(如Protein Thermal Shift 染料),實時定量PCR系統上運行實時熔解實驗,根據因蛋白熔解導致熒光圖像差異,分析配體與蛋白的結合穩定性。可用于以高通量篩選配體與蛋白的結合, 篩選能與蛋白靶點結合的小分子和片段文庫候選藥物、抗體,鑒定最佳緩沖液條件以改善蛋白的純化和分離等。8、食品安全和GMO(genetically modified organism)檢測實時熒光定量PCR技術用于食品的微生物污染監測、肉食類食品食材來源和組成的檢驗、如轉基因動植物基因的檢測等。9、耐藥基因檢測等
性能特點
QuantStudio 3實時熒光定量PCR儀體型小巧,既能通過簡單直觀的大尺寸彩色觸摸屏交互式操作,也可以進行常規PC聯機操作和數據處理。
1、多種樣品通量可選同時支持標準和快速反應模式:標準模式運行時間不到2小時,快速模式可在30分鐘內獲得結果;QuantStudio 3支持96×0.2mL或 96×0.1mL Fast兩種反應模塊;
2、VeriFlex 梯度控溫技術采用了Veriflex梯度溫控模塊,VeriFlex 模塊Applied Biosystems 96孔模塊采用 VeriFlex 技術,具有三個獨立的溫度區,可實現精準的溫度控制和優化。3、先進的OptiFlex光學系統OptiFlex技術具有高亮度白光半導體光源和檢測系統,確保孔與孔間測試數據精確;具有更靈敏數據采集性能,可檢測單重分析反應中1.5倍的拷貝數差異,獲得10log線性動態范圍;具有多重實時熒光定量檢測功能,最多可支持靶標數可達4個。
4、qPCR 數據分析軟件分析軟件具有桌面版和基于Web瀏覽器版,能夠支持云端服務器平臺,能實時在線通過云平臺進行遠程控制實驗;可選 Applied Biosystems 云端qPCR 數據分析軟件模塊,實現強大的分析功能;將實驗數據實現云端安全存儲,便于在線分享測試結果。
5、新型技術服務支持由經過專業培訓的現場服務工程師現場安裝SmartStart Orientation 實踐培訓套餐使用智能遠程支持工具更快地排除故障和解決問題。
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