主要功能用途
Applied Biosystems QuantStudio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex實時熒光定量PCR儀借助于PCR反應體系中加入的熒光基團,可實時監測PCR全過程累積的熒光信號,通過熒光信號的分析對比分析,實現準確可靠地定性、相對定量和絕對定量分析。
主要應用功能包括:
1、基因表達分析
動植物和微生物在生理病理、環境及外來脅迫下相關基因表達的變化分析以及SiRNA誘導基因沉默和基因敲除后特定基因表達水平的檢測。
2、miRNA表達水平的檢測
基于miRNA與特定靶基因mRNA表達水平變化間的關聯,研究miRNA 調控基因表達機制。
3、基因分型(SNP genotyping,Genotyping)
利用TaqMan探針、飽和DNA染料HRM曲線分析進行基因分型,得出等位基因頻率、基因型占總基因型比率等??蓱糜谌邕z傳病診斷,SNP基因分型,藥物代謝酶DME基因分型,法醫遺傳學鑒定等。
4、拷貝數變異(CNV)
拷貝數變異(Copy number variation, CNV)是指因基因組發生重排而導致長度1KB以上的基因片段的缺失(減少)、插入、重復(增加)、重排、倒 位、DNA 拷貝數目變化,也稱為拷貝數多態性(copy number polymorphisms, CNPs)。是造成物種個體差異和人類許多疾病(如癌癥、遺傳性疾病、心血管疾?。┑囊环N重要遺傳基礎。熒光實時定量PCR檢測初始樣品的某個DNA 片段的拷貝數進行定量,用已知拷貝數為2的DNA內參校正而實現對目DNA 片段拷貝數的確認。
5、高分辨率溶解曲線分析(High resolution melt, HRM)
DNA序列長度、GC 含量及堿基互補性差異影響DNA雙鏈結構的熱穩定性。高分辨熔解曲線(high-resolution melt,HRM) 分析是通過實時監測升溫過程中與雙鏈DNA特異性結合的熒光染料釋放的綠色熒光強度的變化,了解PCR 產物中DNA分子的解鏈溫度情況,分析樣品特定基因片段DNA組成變化。實時熒光定量PCR實驗運行程序中引入溶解曲線分析環節后,可借助于專用HRM分析模塊完成HRM分析。HRM用于突變掃描和基因分型,不受突變堿基位點和種類限制,既可對未知突變進行篩查、掃描,又能對已知突變進行分析,還可用于STR分析。
6、病原體檢測(Pathogen detection)
實時熒光定量PCR儀能可靠用于臨床醫學人體上呼吸道的感染、肺炎、消化道感染、中樞神經系統等疾病,以及畜牧業、農作物病蟲害的病原體的檢測確認、感染嚴重程度的量化評估。
7、蛋白熱漂移分析(Protein thermal shift)
利用實時定量PCR儀來分析熱穩定性,進行配體-蛋白結合的高通量篩選,突變或修飾對蛋白熱穩定性的影響
使用蛋白結合染料(如Protein Thermal Shift 染料),實時定量PCR系統上運行實時熔解實驗,根據因蛋白熔解導致熒光圖像差異,分析配體與蛋白的結合穩定性??捎糜谝愿咄亢Y選配體與蛋白的結合, 篩選能與蛋白靶點結合的小分子和片段文庫候選藥物、抗體,鑒定最佳緩沖液條件以改善蛋白的純化和分離等。
8、食品安全和GMO(genetically modified organism)檢測
實時熒光定量PCR技術用于食品的微生物污染監測、肉食類食品食材來源和組成的檢驗、如轉基因動植物基因的檢測等。
9、耐藥基因檢測等
性能特點
Applied Biosystems QuantStutio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex實時熒光定量 PCR儀具有簡化易用的工作流程、直觀應用軟件和大型觸摸屏界面。可以直接在觸摸屏上實施實驗參數設置、啟動和運行監控和實驗數據分析。數據分析程序可將多個數據集整合在一處并以數據可視化形式呈現和分析。
1、樣品反應模塊可互換
與QuantStutio 1/3/5只能運行單一樣品模塊不同,QuantStutio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex可運行標準96×0.2 mL、快速96×0.1 mL、高通量384孔和TaqMan陣列卡(TAC)檢測模塊共4種反應模塊。
TaqMan 陣列卡使用很少的樣品量,在10分鐘內只需8個移液步驟即可加載多達384個靶標。
模塊更換極其簡便:只需按下按鈕或使用語音命令,即在96孔(0.1和0.2 mL)、384孔和 TaqMan 陣列卡間輕松切換。
2、多重熒光定量分析
QuantStudio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex實時熒光定量PCR儀的OptiFlex光學檢測系統,采用寬光譜、高強度白色LED光源,發射波長范圍寬,完美勝任最多6重實時熒光定量分析(Multiplex qPCR)應用。
3、實驗數據規范化
QuantStudio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex實行用戶賬戶管理控制,可建立標準化的實驗協議和調用實驗模版,提供符合MIQE指南要求的實時數據標記語言(Real-Time Data Mark-Up Language,RDML)導出功能。
與QuantStudio 7 Flex比, QuantStudio 7 Pro還具有以下4-6項新型功能。
4、VeriFlex多溫度梯度控制模塊
QuantStutio 7 Pro采用 VeriFlex溫控模塊,能在同一次運行中運行6種不同引物退火溫度,便于反應條件的優化(QuantStudio 7 Flex為普通等溫樣品模塊)。
5、智能操作功能
QuantStutio 7 Pro支持智能功能,可以通過面部認證和語音命令(如open Pro instrument, Change block等)免提操作,快速訪問個人實驗模板和資料。
智能幫助(Smart Help)允許用戶直接從觸摸屏直接聯系技術支持。由經驗豐富的技術人員根據用戶的偏好(電話或電子郵件)進行響應,提供支持。
6、遠程運行及云數據管理
借助于云平臺,QuantStutio 7 Pro可以直接從移動設備遠程設置實驗、控制儀器運行(QuantStudio 6 Flex只能通過電腦聯機接入云平臺)。
用戶不僅可隨時隨地訪問、存儲和在線數據共享。還可以基于web瀏覽器的分析模塊工具軟件,進行包括相對定量、標準曲線、高分辨率熔體(HRM)、基因分型和存在/缺失等在內的多種qPCR分析。
7、FDA 21 CFR Part 11合規管理功能
儀器軟件內含安全、審計、電子簽名套件,符合美國聯邦法規第21 章第11節法規(21 CFR Part 11) 的特定要求??勺詣佑涗浵到y上的所有操作,即對用戶登入、用戶專屬的默認程序設定、操作進行監管并記錄,用戶僅能執行特定功能,所有實驗流程都依管理者設定進行。
8、自動化兼容性
其他實驗室自動化系統集成,實現全天候自動板加載自動化,提高生產率并減少手動任務。
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